Back جينبنك Arabic GenBank Byelorussian GenBank BS GenBank Czech GenBank German Genbank Greek GenBank English GenBank Esperanto GenBank Spanish ژن‌بانک Persian

GenBank

Infotaula de lloc webGenBank
URLhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/
TipusBase de dades de seqüències de nucleòtids
Temamedicina i gen Modifica el valor a Wikidata
LlicènciaDomini públic - Govern dels Estats Units
Part deCentre Nacional per la Informació de Biotecnologia - NCBI
CreadorLaboratori Nacional Los Álamos
Llançament1979 (1979)
SeuBethesda, Maryland
EstatActiu

GenBank és una base de dades pública que conté seqüències de nucleòtids i anotacions bibliogràfiques i biològiques de suport. Va ser creada pel Laboratori Nacional Los Álamos i és distribuïda pel Centre Nacional per la Informació de Biotecnologia (NCBI), una divisió de la Biblioteca Nacional de Medicina dels Estats Units (NLM). GenBank forma part de la Col·laboració Internacional de Bases de Dades de Seqüències de Nucleòtids (International Nucleotide Sequence Database Collaboration, INSDC) i intercanvia dades amb l'Arxiu Europeu de Nucleòtids (ENA) i el DNA DataBank del Japó (DDBJ) diàriament.[1]

L’objectiu de Genbank és garantir que hi hagi una col·lecció uniforme i completa d’informació de seqüències a tot el món. L’NCBI posa a disposició les dades de GenBank sense cap cost a través d’una àmplia gama de serveis de recuperació, entre ells Internet i FTP.[2]

Gràfic que mostra el creixement de la base de dades GenBank de NCBI, a escala semilogarítmica per demostrar l’augment exponencial.
Creixement de Genbank en parells de bases, des del 1982 al 2020, en escala semilogarítmica.

NCBI construeix GenBank principalment a partir d’enviaments de dades de seqüències de laboratoris individuals, a més de contribucions massives de centres de seqüenciació de gran escala. GenBank i els seus col·laboradors reben seqüències de més de 100,000 organismes diferents produïdes a laboratoris arreu del món.[1]

La base de dades va ser creada el 1979 en el Laboratori Nacional de Los Alamos (LANL), a Nou Mèxic, EEUU, per Walter Goad. GenBank ha esdevingut una base de dades important per a la recerca en camps biològics i en els darrers anys ha crescut a un índex exponencial, doblant el número de dades cada 12 mesos.[1]

La versió 240, publicada a l’octubre del 2020, conté més de 650 mil milions de parells de bases, en més de 200 milions de seqüències. GenBank és construït amb contribucions de laboratoris individuals, així com d’enviaments massius de centres de seqüenciació a gran escala.[3]

Les seqüències obtingudes de GenBank es poden utilitzar per fer estudis d'alineament de seqüències mitjançant el programa informàtic BLAST (Basic Local Alignment Search Tool).[4]

  1. ↑ 1,0 1,1 1,2 Sayers, Eric W.; Cavanaugh, Mark; Clark, Karen; Ostell, James; Pruitt, Kim D. «GenBank». Nucleic Acids Research, 48, D1, 01 08, 2020, pàg. D84–D86. DOI: 10.1093/nar/gkz956. ISSN: 1362-4962. PMC: 7145611. PMID: 31665464.
  2. ↑ Benson, Dennis A.; Cavanaugh, Mark; Clark, Karen; Karsch-Mizrachi, Ilene; Ostell, James «GenBank». Nucleic Acids Research, 46, D1, 01 04, 2018, pàg. D41–D47. DOI: 10.1093/nar/gkx1094. ISSN: 1362-4962. PMC: 5753231. PMID: 29140468.
  3. ↑ «Current GenBank Release Notes» (en anglès). [Consulta: 19 desembre 2020].
  4. ↑ «GenBank Overview». [Consulta: 20 desembre 2020].

Developed by StudentB